Chloe en Oliver worden verkeerdelijk aanzien voor FBI-agenten en worden gevangen genomen door Desaad. Wanneer hij beseft wie hij heeft opgesloten, probeert hij Cloe aan zijn kant te krijgen. Ondertussen probeert Lois haar vriend Clark bij te staan met raad en daad.

Terwijl Lois en Clark het debat op tv volgen waar Clark's moeder één van de sprekers is, slaat het noodlot plotseling toe wanneer de senator wordt neergeschoten. Clark is doodongerust over de veiligheid van zijn moeder, terwijl Chloe en Lois hem proberen op te beuren.

In de nasleep van Hawkman's begrafenis worden de helden gevangen genomen en vervolgens opnieuw vrijgelaten. Black Canary gelooft dat Chloe Sullivan hier voor iets tussen zit. Clark en Oliver weten niet langer wie ze nog echt kunnen vertrouwen.

Meer en meer burgers komen in opstand na de doortocht van het VRA. Ondertussen slaagt Slade er in om Lois te ontvoeren. Om haar te bevrijden, zoekt Clark hulp bij zijn bondgenoten Hawkman en Stargirl.

Tess krijgt een Kryptondoos in handen die ooit aan Lionel Luthor toebehoorde. Wanneer Clark de doos per ongeluk activeert, wordt hij getransporteerd naar een parallel universum. Lionel vindt Clark in de graanvelden terug. In dit universum is Clark Luthor een moordenaar en is Lois verloofd met Oliver. Terwijl Clark uitzoekt hoe hij terug naar de aarde kan, moet hij zien te voorkomen dat Lionel ontdekt dat hij niet zijn echte zoon is.

In een poging om de rest van het team te beschermen, besluit Oliver om zich in te schrijven voor The Vigilante Registration Act. Zo wil hij meer te weten komen over de plannen van de overheid over deze nieuwe wet. Zoals hij verwachtte, blijkt het slechts om een val te gaan om superhelden gevangen te kunnen nemen. Slade en zijn nieuwe vrouw Mera steken Clark een handje toe om Oliver te bevrijden. Ondertussen raakt Lois gefrustreerd omdat Clark haar hulp aan het team steeds weigert en daarom bewijst ze maar al te graag dat ook zij met de grote jongens kan meespelen.

Lois vind een video die haar moeder, Ella Lane, voor haar maakte net voor ze stierf. Na het bekijken van de tape maakt Lois een drastische beslissing over haar relatie met Clark, dat haar naar The Fortress brengt, waar ze oog in oog komt te staan met Jor-El en Lara. Ondertussen heeft Tess een nachtmerrie over zichzelf als kind met een muziekdoos. Wanneer ze ontwaakt vind ze de muziekdoos in Luthor Mansion en gaat ze op zoek naar degene die ze daar achterliet...

The General en Lucy Lane verrassen Lois en Clark tijdens een verrassingsetentje voor Thanksgiving. Clark en The General beleven een woelige start van de avond, nadat Lois haar vader de superhelden lik op stuk gaf en Clark er op wees dat hij een wet probeert te overtreden. Ondertussen liegt Rick Flagg tegen Lucy om zo Clark lang genoeg van de farm weg te houden, zodat hij zijn moordplan ongestoord kan uitvoeren...

Clark is bezorgd om de veiligheid van Lois en probeert haar de overtuigen dat ze beter een andere reportage kan brengen dan diegene waar ze haar zinnen op heeft gezet. De bezorgde reactie van Clark bevalt Lois niet, waarop ze hem duidelijk maakt dat ze haar eigen boontjes wel kan doppen. Maar dan strooit een lekke band roet in het eten en raakt Lois in gevaar...

In een poging om Clark op te vrolijken, overtuigt Lois hem om naar hun schoolreünie in Smallville te gaan. Een bezoekje aan het thuisfront van de Crows roept bij Clark herinneringen op aan vervlogen tijden met Lana en Chloe, terwijl Lois woedend is omdat niemand haar vijf dagen als studente heeft onthouden. Brainiac 5.0 keert terug uit de toekomst en neemt Clark mee doorheen zijn verleden, het heden en de toekomst.